L'insegnamento della microbiologia nell'Indirizzo BIOLOGICO è finalizzato all'acquisizione delle seguenti abilità:

1. Sviluppare la consapevolezza del ruolo che lo studio dei microrganismi riveste nella comprensione globale del "fenomeno vita"

2. Stimolare la riflessione sulla complessità del rapporto microrganismi/ambiente, microrganismi/uomo

3. Sviluppare la consapevolezza delle peculiarità e delle analogie della ricerca microbiologica rispetto ad altre metodologie di ricerca scientifica

4. Sviluppare la capacità di progettare, condurre e valutare ricerche sperimentali

5. Sviluppare la capacità di comunicare correttamente e con linguaggio specifico adeguato fenomeni biologici, procedure e risultati di un'indagine scientifica

In coerenza con la finalità generale dell'Indirizzo, che è quella di "... assicurare una preparazione flessibile e dinamica, a forte spessore culturale, ...", ma anche di conseguire una professionalità di base "... spendibile in laboratorio ... e sul campo... " , e con le finalità specifiche del corso di Microbiologia, sopra riportate, si è operata una mediazione tra l'insieme delle conoscenze disciplinari fondanti e quelle relative agli aspetti applicativi, di modo che la presenza della Microbiologia nel curricolo dell'indirizzo si caratterizzasse sia per l'apporto pre-professionalizzante, sia per il contributo culturale.
La complessità delle tematiche microbiologiche, alle quali afferiscono saperi diversi (la biochimica, la genetica, la biologia molecolare, l'ecologia, la fisiologia e l'igiene), e l'oggettiva difficoltà del laboratorio microbiologico che richiede tempi lunghi di preparazione, esecuzione ed interpretazione delle esperienze, ha suggerito il criterio guida nella selezione dei contenuti e delle esperienze di laboratorio: mettere in luce il contributo specifico, in termini di strumenti, metodologie, concetti e teorie, che la Microbiologia può dare alla comprensione del fenomeno vita nel suo complesso.

La strutturazione della programmazione in Moduli,come unità concettuali tra loro correlate, ma non in maniera lineare, permette all'insegnante di organizzare il proprio progetto didattico avendo come punto di riferimento fondamentale quella precisa classe a cui il progetto è rivolto, e non un qualsiasi gruppo di studenti.